En la conquista española que fue un extenso periodo pasa de todo, habían indígenas que apoyaban a europeos y europeos que peleaban entre si, por interés propios, Francisco Pizarro y Diego de Almagro.

Pizarro se había se había enterado que en el sur había muchas riquezas, entonces se dispuso a conseguir socios para que lo pudieran ayudar. Pero él solo quería los beneficios para él mismo, y ser único conquistador del Tahuantinsuyo, mientras los otros se hacen presentes en Cajamarca, Pizarro hace ejecutar a Atahualpa, Almagro consigue el gobierno del sur, diciendo que el cuzco es de su jurisdicción, pero Pizarro, respaldado por el rey de España, envió a Hernando Pizarro (su hermano), quien derrotó y capturó a Almagro en la batalla de Salinas (1538). Almagro fue ejecutado, pero el hijo de de Almagro, Diego de Almagro el Mozo, buscó venganza y mató a Francisco Pizarro en Lima- Perú en 1541

Después de años de traiciones, batallas finalmente su control directo sobre Perú. En 1542 se estableció un virreinato hacia el Perú, y las guerras civiles entre los propios conquistadores habían llegado a su final.