La taxonomía microbiana es la ciencia que se encarga de clasificar, nombrar y organizar a los microorganismos en grupos jerárquicos según sus características. Aunque puede parecer algo teórico, en el laboratorio clínico tiene una aplicación práctica fundamental. Identificar correctamente a un microorganismo ya sea una bacteria, hongo, virus o parásito es el primer paso para establecer un diagnóstico preciso y un tratamiento efectivo.