La división entre biogeografía histórica y biogeografía ecológica es fundamental:
La histórica se centra en cómo los cambios geológicos (como la ruptura de Pangea) y evolutivos explican la aparición de especies en continentes distintos.
La ecológica observa cómo los factores actuales, como el clima, la altitud o la competencia entre especies, determinan la presencia o ausencia de organismos en ciertos lugares.
Esta división permite un estudio más completo de los patrones de distribución, al combinar la perspectiva temporal (pasado) con la espacial (presente).