Una de las causas fue la ambición de Pizarro ya que estevveia al Tahuantinsuyo como un recurso para su beneficio personal. También había el conflicto entre algunos conquistadores por la ambición o por querer quedarse con los territorios sin embargo algunos de ellos no poseian recursos entonces tenían que aliarse con otros 

También al momento de repartir sus riquezas la distribución de esta era desigual las tierras, la riqueza esto creo resentimiento entre los conquistadores creando resentido. 

Este conflicto debilitó el control español la lucha entre ellos mismos hizo que se creará un vacío de poder esta inestabilidad hizo que los indígenas tuvieran más resistencia 

También por la muerte de Pizarro tuvieron una nueva reorganización surgieron nuevos líderes y estoy freno el crecimiento económico para la corona española